Chanaka Mannapperuma
-Senior dataforskare i bioinformatik
OM MIG
Jag har mer än 10 års erfarenhet av att utveckla bioinformatikverktyg och designa dem utifrån användarupplevelser och HCI designprinciper. För närvarande arbetar jag som Senior dataforskare i bioinformatik på AstraZeneca, Sverige och bidrar till utvecklingen av
2015 började jag doktorera i bioinformatik under handledning av Nathaniel Street och John Waterworth ch försvarade framgångsrikt avhandlingen med titeln Principer för interaktion mellan människa och dator för att utveckla webbaserade genomikresurser in 2020. Under mina doktorandstudier fick jag praktisk förståelse för biologiskt användarbeteende och behov, utföra olika användbarhetsforskning och vikten av deltagande designmetoder. Samtidigt lyckades jag leda utvecklingen av Plant Genome Integrative Explorer (PlantGenIE) plattform baserad på användbarhetsforskning och användarupplevelse.
Jag började min yrkesväg vid University of Colombo, där jag tog en kandidatexamen i datavetenskap 2007. 2009, efter att ha arbetat som mjukvaruingenjör i flera outsourcingföretag, flyttade jag till Sverige för att påbörja forskarstudier. Jag tog MSc in Human-Computer Interaction (HCI) på Umeå universitet för att göra webbaserade bioinformatikverktyg för forskare inom biologi. Från 2011 till 2015 arbetade jag som mjukvaruutvecklare och designer på Umeå Plant Science Centre (UPSC) to make web-based bioinformatics tools for researchers in biology. From 2011 till 2015, I worked as a software developer and designer at UPSC där jag tog initiativet till att arbeta med bioinformatik.
Mitt huvudintresse är att designa användbara och användarvänliga system baserade på mikrofrontends och mikrotjänstarkitekturer samtidigt som jag använder molntjänsterna, meddelandeförmedlarsystemen och containerorkestreringssystem. Jag är också intresserad av att ha en eller flera användare i designteamet för att fånga de verkliga användarkraven och använda den iterativa designcykeln genom hela det agila ramverket (AFe) ..
Jag har bott i Umeå mer än ett decennium. Därför är jag bekant och njuter av den kulturella mångfalden och den goda atmosfären i Sverige.
Jag är säker på att jag kan använda min teoretiska kunskap och praktiska forskningserfarenhet för att förbättra användbarheten usability och användarupplevelsen (UX) av produkter och tjänster till nästa nivå. Här listade jag några av nyckelpublikationerna som är baserade på mainstream forskning om att göra användbara verktyg och utföra användbarhetsforskning.
Doktorsavhandling:
Principer för interaktion mellan människa och dator för att utveckla webbaserade genomikresurser
Några utvalda publikationer:
• Designa användbara bioinformatikverktyg för specialiserade användare
• PlantGenIE-PLAZA: integrera ortologi i PlantGenIE.org-resursen med hjälp av PLAZA pipeline
• The Plant Genome Integrative Explorer Resource: PlantGenIE.org
• Rumsligt upplösta transkriptomprofiler i modellväxter
Du kan hitta mer på min Google Scholar-profil eller Umeå universitets webbplats.
Kompetens och erfarenheter
BSc i datavetenskap, MSc i HCI: UI/UX-design och doktorsexamen i bioinformatik.
Omfattande erfarenhet av användbarhetsmetoder och designprinciper.
Erfarenhet inom akademin och bioinformatik
Vetenskapliga publikationer och bioinformatikverktyg
Design och utveckling
Hur bygger man verktyg, från idé till prototyp till produktion, baserat på vanliga HCI-metoder för att få biologiska insikter i storskaliga datamängder?
HCI-principer för utveckling av webbaserade genomikresurser